IBM, Mayo Form Open-source Health IT Consortium

Biomedicinske informatikforskere hos IBM og Mayo Clinic har lanceret et nyt open source-konsortium med fokus på behandling af naturligt sprog (NLP) med det formål at hjælpe lægerne med at dele diagnose- og behandlingsinformation.

Open Health Natural Language Processing Consortium, der blev annonceret torsdag, vil fokusere på teknologi til at muliggøre omfattende dataaggregering, der gør det muligt for læger at lægge lægejournaler i deres specialiteter for at finde lignende tilfælde at studere, før de gør vanskelige diagnoser, eller inden behandlingen afgøres.

Læger vil kunne gennemgå eventuelle lægeanvisninger om lignende tilfælde, men ingen personligt identificerbare patientoplysninger vil være tilgængelige i databasen, sagde IBM og Mayo.

Med lanceringen af ​​konsortiet har de to organisationer udgivet to projekter under åben sourc e-licenser, en fokuseret på kliniske noter og en om patologiske rapporter. Konsortiet bruger Apache-licensen, version 2.0.

Organisationerne inviterer andre til at hjælpe med at udvikle NLP-værktøjer. "Ved at gøre det til et open source-initiativ håber vi at muliggøre en bred anvendelse af disse NLP-værktøjer, så medicinske fremskridt kan ske hurtigere og mere effektivt", siger Dr. Christopher Chute, en bioinformatikekspert i Mayo Clinic og seniorkonsulent om projektet. en erklæring.

To andre sundhedsvæsenorganisationer, Seattle Group Health og US Department of Veterans Affairs Boston Healthcare System, planlægger at deltage i konsortiet, og andre deltagere er velkomne, sagde IBM og Mayo.

Som mere sundhed plejepersonale vedtager elektroniske patientjournaler, bliver det stadig vigtigere for at kunne søge disse journaler, siger organisationerne. Mayo og IBM har udviklet et system til udtrækning af information fra mere end 25 millioner tekstbaserede kliniske noter baseret på IBMs open source ustrukturerede informationsstyringsarkitektur eller UIMA. De 9 organisationer har også udviklet et system til uddrag kræftsygdomme karakteristika fra patologirapporter, der gør det muligt at beregne kræftstadiet.

"Storformet informationsudvinding fra den kliniske fortælling er en vigtig komponent i fremme af translationel forskning og patientpleje", Guergana Savova, en medicinsk informatikspesialist og Mayo føre på projektet, sagde i en erklæring. "Det 'låser' de kliniske tekstdata, der findes i store arkiver. En sådan teknologi vil muliggøre omfattende dataaggregering, analyser og brug - bare forestill dig datakraften fra millioner af patienter."

Organisationerne har ikke endnu besluttet, hvad NLP projekter til at arbejde på næste, en IBM talskvinde sagde. "Målet er først at få feedback fra deltagende institutioner om det oprindelige projekt, og derefter udvide," sagde hun.